[gridengine users] Automatic CPU core binding - JSV script

[Gabor Roczei]

Dear Reuti,

On 2012.01.11., at 22:19, Reuti wrote:

> Hi,
>
> Am 11.01.2012 um 22:02 schrieb Gabor Roczei:
>
>> I am looking for a JSV script which can assign CPU core binding to  
>> parallel and  array jobs in automatic way. Is there such script  
>> somewhere on the web which can be used for SGE 6.2u5? I will be  
>> very glad if someone could share with me this.
>
> what are you looking for in detail? The built-in `qsub -binding ...`  
> is not sufficient, or you just want to automate this?

Our users did not use "-binding" parameter when they submit a job and  
I would like to set it with JSV script. We have a SGI UltraViolet 1000  
SMP (ccNUMA)  supercomputer which has this CPU topology:

hl:m_topology=SCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSC 
CCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCC 
CCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCC 
CSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCS 
CCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCC

The processes context switch is too high and we would like to use this  
automatic binding feaute to decrease it and speed up the jobs.

Gabor